Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms