Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms