Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms