Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD1B0YJ81 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms