Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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