Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms