Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT87PA6NCN2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms