Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC144AA2RUR9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms