Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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