Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SETD1BQ9UPS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SETD1BQ9UPS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SETD1BQ9UPS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SETD1BQ9UPS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SETD1BQ9UPS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SETD1BQ9UPS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SETD1BQ9UPS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SETD1BQ9UPS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SETD1BQ9UPS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SETD1BQ9UPS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SETD1BQ9UPS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SETD1BQ9UPS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SETD1BQ9UPS6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SETD1BQ9UPS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SETD1BQ9UPS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms