Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA2Q9UJY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GGA2Q9UJY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GGA2Q9UJY4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms