Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TUBE1Q9UJT0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBE1Q9UJT0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBE1Q9UJT0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TUBE1Q9UJT0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms