Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH22Q9UJ99 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CDH22Q9UJ99 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDH22Q9UJ99 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDH22Q9UJ99 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms