Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF10DQ9UBN6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF10DQ9UBN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF10DQ9UBN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms