Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKIPSDQ9NZQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKIPSDQ9NZQ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms