Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TREX1Q9NSU2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TREX1Q9NSU2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREX1Q9NSU2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TREX1Q9NSU2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TREX1Q9NSU2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREX1Q9NSU2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms