Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX1Q9H3N1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMX1Q9H3N1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMX1Q9H3N1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX1Q9H3N1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX1Q9H3N1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms