Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF39Q9H2S5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF39Q9H2S5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF39Q9H2S5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF39Q9H2S5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms