Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM7Q9C029 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM7Q9C029 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM7Q9C029 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM7Q9C029 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms