Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms