Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MMS19Q96T76 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMS19Q96T76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMS19Q96T76 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MMS19Q96T76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms