Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SncbQ91ZZ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SncbQ91ZZ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SncbQ91ZZ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SncbQ91ZZ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SncbQ91ZZ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms