Protein–RNA interactions for Protein: Q8R480

Nup85, Nuclear pore complex protein Nup85, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup85Q8R480 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup85Q8R480 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup85Q8R480 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup85Q8R480 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup85Q8R480 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup85Q8R480 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup85Q8R480 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms