Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4F7

RNF175, RING finger protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF175Q8N4F7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF175Q8N4F7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF175Q8N4F7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF175Q8N4F7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF175Q8N4F7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF175Q8N4F7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF175Q8N4F7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms