Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNTROBQ8N137 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNTROBQ8N137 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CNTROBQ8N137 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CNTROBQ8N137 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CNTROBQ8N137 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms