Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RIMS1Q86UR5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RIMS1Q86UR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RIMS1Q86UR5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RIMS1Q86UR5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
RIMS1Q86UR5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
RIMS1Q86UR5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RIMS1Q86UR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RIMS1Q86UR5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RIMS1Q86UR5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RIMS1Q86UR5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
RIMS1Q86UR5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
RIMS1Q86UR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RIMS1Q86UR5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RIMS1Q86UR5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RIMS1Q86UR5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RIMS1Q86UR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RIMS1Q86UR5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RIMS1Q86UR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.82
RIMS1Q86UR5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
RIMS1Q86UR5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.82■■■■□ 3.81
RIMS1Q86UR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RIMS1Q86UR5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms