Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13LQ71F56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED13LQ71F56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED13LQ71F56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MED13LQ71F56 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms