Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHBDF2Q6PJF5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHBDF2Q6PJF5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RHBDF2Q6PJF5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHBDF2Q6PJF5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms