Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PRPF40BQ6NWY9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRPF40BQ6NWY9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRPF40BQ6NWY9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRPF40BQ6NWY9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRPF40BQ6NWY9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRPF40BQ6NWY9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms