Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHEQ5VZ18 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHEQ5VZ18 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHEQ5VZ18 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms