Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CEP350Q5VT06 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CEP350Q5VT06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP350Q5VT06 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP350Q5VT06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP350Q5VT06 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP350Q5VT06 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP350Q5VT06 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP350Q5VT06 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP350Q5VT06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP350Q5VT06 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CEP350Q5VT06 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP350Q5VT06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CEP350Q5VT06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CEP350Q5VT06 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CEP350Q5VT06 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CEP350Q5VT06 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CEP350Q5VT06 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CEP350Q5VT06 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CEP350Q5VT06 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CEP350Q5VT06 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CEP350Q5VT06 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CEP350Q5VT06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms