Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPIN4Q56A73 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIN4Q56A73 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIN4Q56A73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIN4Q56A73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms