Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc160Q3UYG1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc160Q3UYG1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc160Q3UYG1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc160Q3UYG1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc160Q3UYG1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc160Q3UYG1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc160Q3UYG1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc160Q3UYG1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc160Q3UYG1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc160Q3UYG1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc160Q3UYG1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms