Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Edem3Q2HXL6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Edem3Q2HXL6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Edem3Q2HXL6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Edem3Q2HXL6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Edem3Q2HXL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Edem3Q2HXL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Edem3Q2HXL6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms