Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL24A1Q17RW2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL24A1Q17RW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
COL24A1Q17RW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL24A1Q17RW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
COL24A1Q17RW2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
COL24A1Q17RW2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms