Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMA3Q16787 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA3Q16787 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMA3Q16787 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA3Q16787 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMA3Q16787 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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