Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 415.98■□□□□ 0.155e-10■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 515.98■□□□□ 0.155e-10■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 512.95□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-8■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-8■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.346e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-210ENST00000479364 1010 ntTSL 510.51□□□□□ -0.736e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-202ENST00000371184 1348 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.826e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.896e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-203ENST00000371185 1714 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -16e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.196e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.226e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.266e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.496e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-209ENST00000476646 730 ntTSL 34.06□□□□□ -1.766e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 PUS1-210ENST00000544213 687 ntTSL 519.4■□□□□ 0.79e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-204ENST00000456665 577 ntTSL 519.4■□□□□ 0.79e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-211ENST00000544662 836 ntTSL 317.25■□□□□ 0.359e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.339e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-207ENST00000538037 631 ntTSL 516.61■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-206ENST00000537484 642 ntTSL 315.69■□□□□ 0.19e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.099e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-206ENST00000458355 914 ntTSL 314.81□□□□□ -0.042e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-201ENST00000322060 1206 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.27□□□□□ -0.139e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.139e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.329e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-207ENST00000588176 574 ntTSL 412.73□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 212.67□□□□□ -0.389e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.459e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-209ENST00000589301 550 ntTSL 412.16□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.559e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-207ENST00000522893 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.762e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-208ENST00000523053 735 ntTSL 210.04□□□□□ -0.89e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 29.64□□□□□ -0.879e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.139e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-211ENST00000591857 681 ntTSL 37.63□□□□□ -1.199e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 26.76□□□□□ -1.339e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-213ENST00000592329 308 ntTSL 25.08□□□□□ -1.69e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-205ENST00000442547 893 ntTSL 54.72□□□□□ -1.652e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.832e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 28.27□□□□□ -1.091e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 57.47□□□□□ -1.214e-7■■■■□ 25.3
SRSF7Q16629 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 55.96□□□□□ -1.464e-7■■■■□ 25.3
SRSF7Q16629 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 55.28□□□□□ -1.564e-7■■■■□ 25.3
SRSF7Q16629 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■■□ 25.2
SRSF7Q16629 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 25.2
SRSF7Q16629 ACSS3-206ENST00000549175 534 ntTSL 59.67□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 25.2
SRSF7Q16629 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 55.78□□□□□ -1.481e-7■■■■□ 25.2
SRSF7Q16629 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 55.78□□□□□ -1.482e-10■■■■□ 25.1
SRSF7Q16629 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt15.45■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-223ENST00000512131 615 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.92□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-206ENST00000503219 551 ntTSL 412.43□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-219ENST00000511237 517 ntTSL 512.32□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-215ENST00000510074 649 ntTSL 512.32□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 412.29□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.1□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 211.53□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-226ENST00000513095 609 ntTSL 411.32□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-205ENST00000502260 727 ntTSL 310.73□□□□□ -0.691e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.25□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-224ENST00000513020 868 ntTSL 39.42□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-208ENST00000478768 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.8□□□□□ -1.161e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 47.49□□□□□ -1.213e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.331e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNTB1-204ENST00000519298 414 ntTSL 34.29□□□□□ -1.721e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-208ENST00000603795 1166 ntTSL 316.61■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-212ENST00000604988 503 ntTSL 511.17□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-207ENST00000603726 587 ntTSL 59.88□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC6.75□□□□□ -1.333e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.673e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.823e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.93□□□□□ -1.943e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 317.33■□□□□ 0.363e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.63e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.633e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.923e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -13e-14■■■■□ 24.7
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