Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 415.98■□□□□ 0.155e-10■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 515.98■□□□□ 0.155e-10■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 512.95□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-8■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-8■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.346e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-210ENST00000479364 1010 ntTSL 510.51□□□□□ -0.736e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-202ENST00000371184 1348 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.826e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.896e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-203ENST00000371185 1714 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -16e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.196e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.226e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.266e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.496e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 NFIA-209ENST00000476646 730 ntTSL 34.06□□□□□ -1.766e-10■■■■□ 25.5
SRSF7Q16629 PUS1-210ENST00000544213 687 ntTSL 519.4■□□□□ 0.79e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-204ENST00000456665 577 ntTSL 519.4■□□□□ 0.79e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-211ENST00000544662 836 ntTSL 317.25■□□□□ 0.359e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.339e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-207ENST00000538037 631 ntTSL 516.61■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-206ENST00000537484 642 ntTSL 315.69■□□□□ 0.19e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.099e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-206ENST00000458355 914 ntTSL 314.81□□□□□ -0.042e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-201ENST00000322060 1206 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.27□□□□□ -0.139e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.139e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.329e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-207ENST00000588176 574 ntTSL 412.73□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 212.67□□□□□ -0.389e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.459e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-209ENST00000589301 550 ntTSL 412.16□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.559e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-207ENST00000522893 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.762e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-208ENST00000523053 735 ntTSL 210.04□□□□□ -0.89e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 29.64□□□□□ -0.879e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.139e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-211ENST00000591857 681 ntTSL 37.63□□□□□ -1.199e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 26.76□□□□□ -1.339e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ACOX1-213ENST00000592329 308 ntTSL 25.08□□□□□ -1.69e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-205ENST00000442547 893 ntTSL 54.72□□□□□ -1.652e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.832e-12■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 28.27□□□□□ -1.091e-7■■■■□ 25.4
SRSF7Q16629 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 57.47□□□□□ -1.214e-7■■■■□ 25.3
SRSF7Q16629 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 55.96□□□□□ -1.464e-7■■■■□ 25.3
SRSF7Q16629 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 55.28□□□□□ -1.564e-7■■■■□ 25.3
SRSF7Q16629 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■■□ 25.2
SRSF7Q16629 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 25.2
SRSF7Q16629 ACSS3-206ENST00000549175 534 ntTSL 59.67□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 25.2
SRSF7Q16629 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 55.78□□□□□ -1.481e-7■■■■□ 25.2
SRSF7Q16629 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 55.78□□□□□ -1.482e-10■■■■□ 25.1
SRSF7Q16629 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt15.45■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-223ENST00000512131 615 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.92□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 25
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SRSF7Q16629 SH3BP2-215ENST00000510074 649 ntTSL 512.32□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 412.29□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.1□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 211.53□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-226ENST00000513095 609 ntTSL 411.32□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-205ENST00000502260 727 ntTSL 310.73□□□□□ -0.691e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.25□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SH3BP2-224ENST00000513020 868 ntTSL 39.42□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNAP47-208ENST00000478768 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.8□□□□□ -1.161e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 47.49□□□□□ -1.213e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.331e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 25
SRSF7Q16629 SNTB1-204ENST00000519298 414 ntTSL 34.29□□□□□ -1.721e-7■■■■□ 25
SRSF7Q16629 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-208ENST00000603795 1166 ntTSL 316.61■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-212ENST00000604988 503 ntTSL 511.17□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 DUSP22-207ENST00000603726 587 ntTSL 59.88□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 24.8
SRSF7Q16629 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC6.75□□□□□ -1.333e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.673e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.823e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.93□□□□□ -1.943e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 317.33■□□□□ 0.363e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.63e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.633e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.923e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -13e-14■■■■□ 24.7
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