Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RAB3GAP1Q15042 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAB3GAP1Q15042 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
RAB3GAP1Q15042 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RAB3GAP1Q15042 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
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