Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHD4Q14839 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHD4Q14839 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CHD4Q14839 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CHD4Q14839 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHD4Q14839 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHD4Q14839 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
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