Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms