Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 HXT10YFL011W 1641 nt7.57□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 CDD1YLR245C 429 nt7.57□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 ENO2YHR174W 1314 nt7.56□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 NAS2YIL007C 663 nt7.56□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 MET1YKR069W 1782 nt7.56□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 PAR32YDL173W 888 nt7.55□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 GNP1YDR508C 1992 nt7.54□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 RPN14YGL004C 1254 nt7.54□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 TPC1YGR096W 945 nt7.54□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 TIM44YIL022W 1296 nt7.54□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 CRC1YOR100C 984 nt7.54□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 MDM35YKL053C-A 261 nt7.53□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 RPC31YNL151C 756 nt7.53□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 snR31snR31 225 nt7.53□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 BEM1YBR200W 1656 nt7.53□□□□□ -1.2
HMS1Q12398 KRR1YCL059C 951 nt7.52□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 CCR4YAL021C 2514 nt7.52□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 HBS1YKR084C 1836 nt7.52□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 THP3YPR045C 1413 nt7.52□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 DPL1YDR294C 1770 nt7.51□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 RIM2YBR192W 1134 nt7.51□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 DUS3YLR401C 2007 nt7.51□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 GGC1YDL198C 903 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 LEU2YCL018W 1095 nt7.5□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 YIL177CYIL177C 5277 nt7.49□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 IGD1YFR017C 588 nt7.49□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 YKL053WYKL053W 375 nt7.49□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 FSH2YMR222C 672 nt7.49□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 SPE2YOL052C 1191 nt7.49□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 CTF3YLR381W 2202 nt7.48□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 NAM8YHR086W 1572 nt7.48□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 SEN2YLR105C 1134 nt7.48□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 KRE1YNL322C 942 nt7.48□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 SAN1YDR143C 1833 nt7.46□□□□□ -1.21
HMS1Q12398 POP2YNR052C 1302 nt7.46□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 KGD2YDR148C 1392 nt7.46□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 YJL064WYJL064W 396 nt7.44□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 REX2YLR059C 810 nt7.44□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.44□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.44□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.44□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 PHB2YGR231C 933 nt7.43□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 AFG2YLR397C 2343 nt7.43□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 SRP54YPR088C 1626 nt7.42□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 ADH3YMR083W 1128 nt7.42□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 AGP3YFL055W 1677 nt7.41□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 LEU4YNL104C 1860 nt7.41□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 NAP1YKR048C 1254 nt7.41□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 PAU19YMR325W 375 nt7.41□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 YIL108WYIL108W 2091 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 YKR012CYKR012C 378 nt7.4□□□□□ -1.22
HMS1Q12398 YEL023CYEL023C 2049 nt7.4□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 TOP3YLR234W 1971 nt7.39□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 SDS24YBR214W 1584 nt7.39□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 FLX1YIL134W 936 nt7.39□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 AIM34YMR003W 597 nt7.39□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 MAS1YLR163C 1389 nt7.38□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 SBP1YHL034C 885 nt7.38□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 IPL1YPL209C 1104 nt7.38□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.37□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.37□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 ADE16YLR028C 1776 nt7.37□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 THI3YDL080C 1830 nt7.36□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 VBA3YCL069W 1377 nt7.36□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 YDR467CYDR467C 327 nt7.36□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.36□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 PUP1YOR157C 786 nt7.36□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 INH1YDL181W 258 nt7.35□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 GPM1YKL152C 744 nt7.35□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 YPT11YNL304W 1254 nt7.35□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.35□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.35□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.35□□□□□ -1.23
HMS1Q12398 GAS1YMR307W 1680 nt7.35□□□□□ -1.23
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