Protein–RNA interactions for Protein: Q12140

BSC1, Bypass of stop codon protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BSC1Q12140 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 MOB1YIL106W 945 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 TRP2YER090W 1524 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 ALD5YER073W 1563 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 SDS24YBR214W 1584 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 PTC6YCR079W 1329 nt7.75□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 MTO1YGL236C 2010 nt7.74□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 HXK1YFR053C 1458 nt7.74□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 GAS1YMR307W 1680 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 VBA3YCL069W 1377 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 FLX1YIL134W 936 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 YOR072WYOR072W 315 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 IPL1YPL209C 1104 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 GGA2YHR108W 1758 nt7.73□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.72□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 YBL095WYBL095W 813 nt7.72□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 AAT1YKL106W 1356 nt7.71□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 PAU19YMR325W 375 nt7.71□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 HMG2YLR450W 3138 nt7.71□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 THI6YPL214C 1623 nt7.7□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 YMC2YBR104W 990 nt7.7□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 YPT11YNL304W 1254 nt7.68□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 ENO1YGR254W 1314 nt7.68□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 HXT11YOL156W 1704 nt7.67□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 MEX67YPL169C 1800 nt7.67□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 NAP1YKR048C 1254 nt7.67□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 YCR025CYCR025C 411 nt7.66□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 EMC3YKL207W 762 nt7.66□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 MIM1YOL026C 342 nt7.66□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 SRM1YGL097W 1449 nt7.66□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 PUP1YOR157C 786 nt7.65□□□□□ -1.18
BSC1Q12140 CYC3YAL039C 810 nt7.63□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 YFR020WYFR020W 699 nt7.62□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 YLR280CYLR280C 351 nt7.62□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 LYS20YDL182W 1287 nt7.61□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 RSM7YJR113C 744 nt7.61□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 MRS4YKR052C 915 nt7.61□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 FTH1YBR207W 1398 nt7.6□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 AAC3YBR085W 924 nt7.6□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 SLG1YOR008C 1137 nt7.59□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 ERO1YML130C 1692 nt7.59□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 HBS1YKR084C 1836 nt7.59□□□□□ -1.19
BSC1Q12140 TPN1YGL186C 1740 nt7.58□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 snR86snR86 1004 nt7.58□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 SER2YGR208W 930 nt7.58□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 SRP102YKL154W 735 nt7.58□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 snR4snR4 186 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 YLR072WYLR072W 2082 nt7.56□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 DUR3YHL016C 2208 nt7.55□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 TMS1YDR105C 1422 nt7.55□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 YJR149WYJR149W 1215 nt7.55□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 NPP1YCR026C 2229 nt7.54□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 YJL009WYJL009W 327 nt7.54□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 ORT1YOR130C 879 nt7.54□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 YGR210CYGR210C 1236 nt7.53□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 YMR210WYMR210W 1350 nt7.53□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 MEP1YGR121C 1479 nt7.53□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 HTS1YPR033C 1641 nt7.52□□□□□ -1.2
BSC1Q12140 SAM50YNL026W 1455 nt7.52□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 MDL2YPL270W 2322 nt7.52□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 ABP1YCR088W 1779 nt7.51□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 LEA1YPL213W 717 nt7.51□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 FCY1YPR062W 477 nt7.51□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 URA8YJR103W 1737 nt7.5□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 YLR460CYLR460C 1131 nt7.5□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 YBR056WYBR056W 1506 nt7.49□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 BUB2YMR055C 921 nt7.49□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 MET22YOL064C 1074 nt7.49□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 DUS3YLR401C 2007 nt7.49□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 SWM1YDR260C 513 nt7.48□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 YIR035CYIR035C 765 nt7.48□□□□□ -1.21
BSC1Q12140 RNA170RNA170 169 nt7.48□□□□□ -1.21
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