Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 MUP1YGR055W 1725 nt10.23□□□□□ -0.77
SSP2Q08646 SPT20YOL148C 1815 nt10.23□□□□□ -0.77
SSP2Q08646 YMR210WYMR210W 1350 nt10.23□□□□□ -0.77
SSP2Q08646 YFR020WYFR020W 699 nt10.22□□□□□ -0.77
SSP2Q08646 ARO8YGL202W 1503 nt10.22□□□□□ -0.77
SSP2Q08646 YPT11YNL304W 1254 nt10.21□□□□□ -0.77
SSP2Q08646 MRP1YDR347W 966 nt10.2□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 GID8YMR135C 1368 nt10.2□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 YOR268CYOR268C 399 nt10.19□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 LSP1YPL004C 1026 nt10.19□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 VMA11YPL234C 495 nt10.19□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 SAN1YDR143C 1833 nt10.17□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 LSR1LSR1 1175 nt10.17□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 KES1YPL145C 1305 nt10.15□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 RSM7YJR113C 744 nt10.15□□□□□ -0.78
SSP2Q08646 YMR166CYMR166C 1107 nt10.14□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 YHR219WYHR219W 1875 nt10.14□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 YKL133CYKL133C 1392 nt10.13□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 PET18YCR020C 648 nt10.12□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 SNX3YOR357C 489 nt10.12□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 KGD2YDR148C 1392 nt10.12□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 COQ8YGL119W 1506 nt10.12□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 PTC6YCR079W 1329 nt10.1□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 MRS6YOR370C 1812 nt10.1□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 KAE1YKR038C 1161 nt10.1□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 GDH1YOR375C 1365 nt10.1□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 GAS1YMR307W 1680 nt10.09□□□□□ -0.79
SSP2Q08646 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.08□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.08□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.08□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.08□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.08□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.08□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.08□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 MFT1YML062C 1179 nt10.08□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 RPD3YNL330C 1302 nt10.07□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 MFG1YDL233W 1377 nt10.07□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 EDC2YER035W 438 nt10.06□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 SBP1YHL034C 885 nt10.06□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 ADA2YDR448W 1305 nt10.06□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 SGA1YIL099W 1650 nt10.06□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 UTR5YEL035C 501 nt10.05□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 YLR460CYLR460C 1131 nt10.05□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 RRT14YIL127C 621 nt10.04□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 CAK1YFL029C 1107 nt10.03□□□□□ -0.8
SSP2Q08646 TAD2YJL035C 753 nt10.01□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 HOL1YNR055C 1761 nt10.01□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 CMP2YML057W 1815 nt10□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 BSP1YPR171W 1731 nt9.99□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 YJR149WYJR149W 1215 nt9.99□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 ELP4YPL101W 1371 nt9.99□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 CHS7YHR142W 951 nt9.98□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 OCH1YGL038C 1443 nt9.98□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 YER156CYER156C 1017 nt9.97□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 TOS1YBR162C 1368 nt9.97□□□□□ -0.81
SSP2Q08646 YPR084WYPR084W 1371 nt9.96□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 YMR206WYMR206W 942 nt9.95□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 MET22YOL064C 1074 nt9.95□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 HOG1YLR113W 1308 nt9.95□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 OLA1YBR025C 1185 nt9.94□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 RPS6AYPL090C 711 nt9.94□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 RPS6BYBR181C 711 nt9.94□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 ZAP1YJL056C 2643 nt9.93□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 KRR1YCL059C 951 nt9.92□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 RPC31YNL151C 756 nt9.91□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 BXI1YNL305C 894 nt9.91□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 HIS2YFR025C 1008 nt9.9□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 ADE1YAR015W 921 nt9.9□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 PRE5YMR314W 705 nt9.9□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 SDH8YBR269C 417 nt9.9□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 BAP3YDR046C 1815 nt9.9□□□□□ -0.82
SSP2Q08646 YJL043WYJL043W 774 nt9.89□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 TDH1YJL052W 999 nt9.88□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 GGA2YHR108W 1758 nt9.88□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 CWP2YKL096W-A 279 nt9.87□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 PDC6YGR087C 1692 nt9.87□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 PET494YNR045W 1470 nt9.86□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 YPT31YER031C 672 nt9.86□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 FUS3YBL016W 1062 nt9.86□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 UGP1YKL035W 1500 nt9.86□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 SSL2YIL143C 2532 nt9.84□□□□□ -0.83
SSP2Q08646 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.83□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 THI3YDL080C 1830 nt9.82□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 RNA170RNA170 169 nt9.82□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 ATP2YJR121W 1536 nt9.82□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 NUP53YMR153W 1428 nt9.82□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 DPL1YDR294C 1770 nt9.81□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 YIR035CYIR035C 765 nt9.79□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 GPM1YKL152C 744 nt9.79□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 YPL247CYPL247C 1572 nt9.79□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 YIL168WYIL168W 384 nt9.78□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 ODC1YPL134C 933 nt9.78□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 RHO1YPR165W 630 nt9.78□□□□□ -0.84
SSP2Q08646 YDR467CYDR467C 327 nt9.75□□□□□ -0.85
SSP2Q08646 THI73YLR004C 1572 nt9.74□□□□□ -0.85
SSP2Q08646 YDR476CYDR476C 675 nt9.72□□□□□ -0.85
SSP2Q08646 BUB2YMR055C 921 nt9.72□□□□□ -0.85
SSP2Q08646 TMS1YDR105C 1422 nt9.71□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.69□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 LEU4YNL104C 1860 nt9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms