Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL27P61353 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL27P61353 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL27P61353 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL27P61353 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL27P61353 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL27P61353 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL27P61353 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL27P61353 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL27P61353 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL27P61353 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL27P61353 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL27P61353 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL27P61353 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL27P61353 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL27P61353 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL27P61353 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL27P61353 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL27P61353 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL27P61353 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL27P61353 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL27P61353 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL27P61353 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL27P61353 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL27P61353 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL27P61353 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL27P61353 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL27P61353 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL27P61353 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL27P61353 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL27P61353 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL27P61353 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL27P61353 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL27P61353 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL27P61353 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL27P61353 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL27P61353 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL27P61353 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL27P61353 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL27P61353 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL27P61353 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL27P61353 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL27P61353 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL27P61353 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL27P61353 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL27P61353 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL27P61353 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL27P61353 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL27P61353 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL27P61353 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL27P61353 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL27P61353 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL27P61353 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL27P61353 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL27P61353 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL27P61353 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL27P61353 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL27P61353 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL27P61353 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL27P61353 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL27P61353 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL27P61353 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL27P61353 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL27P61353 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL27P61353 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL27P61353 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL27P61353 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL27P61353 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL27P61353 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL27P61353 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL27P61353 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL27P61353 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL27P61353 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL27P61353 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL27P61353 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL27P61353 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL27P61353 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL27P61353 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL27P61353 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL27P61353 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL27P61353 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL27P61353 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL27P61353 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL27P61353 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL27P61353 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL27P61353 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL27P61353 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL27P61353 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL27P61353 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL27P61353 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL27P61353 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL27P61353 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms