Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRLP54845 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRLP54845 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRLP54845 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NRLP54845 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRLP54845 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRLP54845 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRLP54845 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NRLP54845 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRLP54845 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRLP54845 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRLP54845 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRLP54845 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRLP54845 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRLP54845 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRLP54845 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRLP54845 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRLP54845 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRLP54845 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRLP54845 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRLP54845 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRLP54845 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRLP54845 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NRLP54845 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRLP54845 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRLP54845 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRLP54845 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRLP54845 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRLP54845 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NRLP54845 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRLP54845 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRLP54845 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NRLP54845 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NRLP54845 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NRLP54845 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRLP54845 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRLP54845 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRLP54845 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRLP54845 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRLP54845 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRLP54845 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRLP54845 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRLP54845 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRLP54845 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRLP54845 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRLP54845 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRLP54845 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRLP54845 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRLP54845 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRLP54845 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRLP54845 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRLP54845 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRLP54845 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRLP54845 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRLP54845 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRLP54845 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRLP54845 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRLP54845 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRLP54845 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRLP54845 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRLP54845 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRLP54845 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRLP54845 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRLP54845 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRLP54845 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRLP54845 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRLP54845 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRLP54845 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRLP54845 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRLP54845 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRLP54845 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRLP54845 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRLP54845 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRLP54845 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRLP54845 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRLP54845 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRLP54845 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRLP54845 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRLP54845 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRLP54845 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRLP54845 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRLP54845 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRLP54845 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRLP54845 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRLP54845 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRLP54845 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRLP54845 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRLP54845 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRLP54845 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NRLP54845 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NRLP54845 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms