Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 RPS6AYPL090C 711 nt13.66□□□□□ -0.22
ATG2P53855 RPS6BYBR181C 711 nt13.66□□□□□ -0.22
ATG2P53855 YLR358CYLR358C 564 nt13.65□□□□□ -0.22
ATG2P53855 SPG1YGR236C 288 nt13.64□□□□□ -0.23
ATG2P53855 NUP53YMR153W 1428 nt13.64□□□□□ -0.23
ATG2P53855 SRY1YKL218C 981 nt13.63□□□□□ -0.23
ATG2P53855 YDL086WYDL086W 822 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG2P53855 YLR046CYLR046C 813 nt13.6□□□□□ -0.23
ATG2P53855 RPR1RPR1 369 nt13.6□□□□□ -0.23
ATG2P53855 YBL095WYBL095W 813 nt13.6□□□□□ -0.23
ATG2P53855 BOR1YNL275W 1731 nt13.59□□□□□ -0.23
ATG2P53855 YER156CYER156C 1017 nt13.59□□□□□ -0.23
ATG2P53855 TDH1YJL052W 999 nt13.59□□□□□ -0.23
ATG2P53855 SBP1YHL034C 885 nt13.58□□□□□ -0.23
ATG2P53855 KGD2YDR148C 1392 nt13.58□□□□□ -0.24
ATG2P53855 BXI1YNL305C 894 nt13.57□□□□□ -0.24
ATG2P53855 PBP1YGR178C 2169 nt13.54□□□□□ -0.24
ATG2P53855 SUV3YPL029W 2214 nt13.52□□□□□ -0.24
ATG2P53855 NCA3YJL116C 1014 nt13.51□□□□□ -0.25
ATG2P53855 KEL3YPL263C 1956 nt13.5□□□□□ -0.25
ATG2P53855 YIL168WYIL168W 384 nt13.5□□□□□ -0.25
ATG2P53855 ITR2YOL103W 1830 nt13.49□□□□□ -0.25
ATG2P53855 RRT6YGL146C 936 nt13.49□□□□□ -0.25
ATG2P53855 ENT4YLL038C 744 nt13.47□□□□□ -0.25
ATG2P53855 CRC1YOR100C 984 nt13.47□□□□□ -0.25
ATG2P53855 YFR020WYFR020W 699 nt13.46□□□□□ -0.25
ATG2P53855 YPR084WYPR084W 1371 nt13.46□□□□□ -0.25
ATG2P53855 HAC1YFL031W 717 nt13.45□□□□□ -0.26
ATG2P53855 CCT2YIL142W 1584 nt13.45□□□□□ -0.26
ATG2P53855 CAK1YFL029C 1107 nt13.45□□□□□ -0.26
ATG2P53855 SAN1YDR143C 1833 nt13.44□□□□□ -0.26
ATG2P53855 YPT11YNL304W 1254 nt13.44□□□□□ -0.26
ATG2P53855 URA1YKL216W 945 nt13.43□□□□□ -0.26
ATG2P53855 YML079WYML079W 606 nt13.43□□□□□ -0.26
ATG2P53855 HAP5YOR358W 729 nt13.43□□□□□ -0.26
ATG2P53855 ILV3YJR016C 1758 nt13.41□□□□□ -0.26
ATG2P53855 OCH1YGL038C 1443 nt13.4□□□□□ -0.26
ATG2P53855 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt13.4□□□□□ -0.26
ATG2P53855 PTC6YCR079W 1329 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG2P53855 PUP2YGR253C 783 nt13.38□□□□□ -0.27
ATG2P53855 YMR265CYMR265C 1386 nt13.37□□□□□ -0.27
ATG2P53855 RSM7YJR113C 744 nt13.36□□□□□ -0.27
ATG2P53855 YOR325WYOR325W 474 nt13.36□□□□□ -0.27
ATG2P53855 OPI10YOL032W 741 nt13.35□□□□□ -0.27
ATG2P53855 MAS2YHR024C 1449 nt13.34□□□□□ -0.27
ATG2P53855 RRT14YIL127C 621 nt13.34□□□□□ -0.27
ATG2P53855 snR31snR31 225 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG2P53855 DLD3YEL071W 1491 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG2P53855 LSR1LSR1 1175 nt13.32□□□□□ -0.28
ATG2P53855 MET22YOL064C 1074 nt13.28□□□□□ -0.28
ATG2P53855 VMA11YPL234C 495 nt13.28□□□□□ -0.28
ATG2P53855 YOR111WYOR111W 699 nt13.28□□□□□ -0.28
ATG2P53855 YAT1YAR035W 2064 nt13.27□□□□□ -0.28
ATG2P53855 YJL144WYJL144W 315 nt13.27□□□□□ -0.29
ATG2P53855 GAS1YMR307W 1680 nt13.25□□□□□ -0.29
ATG2P53855 YDR476CYDR476C 675 nt13.25□□□□□ -0.29
ATG2P53855 CHS7YHR142W 951 nt13.24□□□□□ -0.29
ATG2P53855 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt13.23□□□□□ -0.29
ATG2P53855 CYS3YAL012W 1185 nt13.22□□□□□ -0.29
ATG2P53855 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt13.22□□□□□ -0.29
ATG2P53855 DOC1YGL240W 753 nt13.21□□□□□ -0.29
ATG2P53855 YLR460CYLR460C 1131 nt13.2□□□□□ -0.3
ATG2P53855 SHC1YER096W 1539 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG2P53855 YHR219WYHR219W 1875 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG2P53855 SLM3YDL033C 1254 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG2P53855 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG2P53855 UME1YPL139C 1383 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG2P53855 RPN14YGL004C 1254 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG2P53855 PIH1YHR034C 1035 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG2P53855 LAT1YNL071W 1449 nt13.15□□□□□ -0.3
ATG2P53855 AVO2YMR068W 1281 nt13.12□□□□□ -0.31
ATG2P53855 RHO1YPR165W 630 nt13.12□□□□□ -0.31
ATG2P53855 APT1YML022W 564 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG2P53855 PDC6YGR087C 1692 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG2P53855 YOX1YML027W 1158 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG2P53855 YPT31YER031C 672 nt13.1□□□□□ -0.31
ATG2P53855 GID8YMR135C 1368 nt13.09□□□□□ -0.31
ATG2P53855 PUS4YNL292W 1212 nt13.09□□□□□ -0.31
ATG2P53855 ATP23YNR020C 813 nt13.09□□□□□ -0.31
ATG2P53855 ATP2YJR121W 1536 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG2P53855 SNX3YOR357C 489 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG2P53855 RDN25-1RDN25-1 3396 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG2P53855 RDN25-2RDN25-2 3396 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG2P53855 MRS6YOR370C 1812 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG2P53855 PSP2YML017W 1782 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG2P53855 RNA170RNA170 169 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG2P53855 NAR1YNL240C 1476 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG2P53855 SPR1YOR190W 1338 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG2P53855 CYT2YKL087C 675 nt13.05□□□□□ -0.32
ATG2P53855 RPC82YPR190C 1965 nt13.02□□□□□ -0.33
ATG2P53855 ESBP6YNL125C 2022 nt13.02□□□□□ -0.33
ATG2P53855 SPE3YPR069C 882 nt13.01□□□□□ -0.33
ATG2P53855 PNS1YOR161C 1620 nt13.01□□□□□ -0.33
ATG2P53855 YBL111CYBL111C 2004 nt13□□□□□ -0.33
ATG2P53855 GAL83YER027C 1254 nt13□□□□□ -0.33
ATG2P53855 THI73YLR004C 1572 nt13□□□□□ -0.33
ATG2P53855 OLA1YBR025C 1185 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG2P53855 YKL133CYKL133C 1392 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG2P53855 INA1YLR413W 2028 nt12.98□□□□□ -0.33
ATG2P53855 POR2YIL114C 846 nt12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms