Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOSBP53539 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOSBP53539 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOSBP53539 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOSBP53539 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOSBP53539 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOSBP53539 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOSBP53539 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOSBP53539 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOSBP53539 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOSBP53539 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOSBP53539 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FOSBP53539 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOSBP53539 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FOSBP53539 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOSBP53539 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOSBP53539 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOSBP53539 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOSBP53539 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOSBP53539 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOSBP53539 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOSBP53539 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOSBP53539 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOSBP53539 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOSBP53539 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOSBP53539 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOSBP53539 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOSBP53539 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOSBP53539 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOSBP53539 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOSBP53539 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOSBP53539 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOSBP53539 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOSBP53539 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOSBP53539 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOSBP53539 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOSBP53539 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOSBP53539 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOSBP53539 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOSBP53539 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOSBP53539 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOSBP53539 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOSBP53539 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOSBP53539 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOSBP53539 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOSBP53539 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOSBP53539 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOSBP53539 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOSBP53539 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOSBP53539 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOSBP53539 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FOSBP53539 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOSBP53539 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOSBP53539 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOSBP53539 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOSBP53539 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOSBP53539 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOSBP53539 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOSBP53539 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOSBP53539 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FOSBP53539 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOSBP53539 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOSBP53539 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FOSBP53539 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOSBP53539 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOSBP53539 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOSBP53539 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOSBP53539 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOSBP53539 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOSBP53539 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FOSBP53539 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOSBP53539 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOSBP53539 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOSBP53539 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOSBP53539 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOSBP53539 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOSBP53539 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOSBP53539 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOSBP53539 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOSBP53539 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOSBP53539 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOSBP53539 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOSBP53539 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOSBP53539 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOSBP53539 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FOSBP53539 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOSBP53539 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOSBP53539 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOSBP53539 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOSBP53539 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOSBP53539 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
FOSBP53539 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOSBP53539 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOSBP53539 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOSBP53539 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOSBP53539 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOSBP53539 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FOSBP53539 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOSBP53539 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOSBP53539 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms