Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMSP52788 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMSP52788 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMSP52788 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMSP52788 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMSP52788 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMSP52788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMSP52788 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMSP52788 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMSP52788 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMSP52788 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMSP52788 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMSP52788 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMSP52788 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMSP52788 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMSP52788 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMSP52788 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMSP52788 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMSP52788 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMSP52788 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMSP52788 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMSP52788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMSP52788 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMSP52788 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMSP52788 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMSP52788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMSP52788 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMSP52788 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMSP52788 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMSP52788 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMSP52788 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMSP52788 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMSP52788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMSP52788 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMSP52788 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMSP52788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMSP52788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMSP52788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMSP52788 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMSP52788 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMSP52788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMSP52788 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMSP52788 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMSP52788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMSP52788 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMSP52788 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMSP52788 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMSP52788 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMSP52788 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMSP52788 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMSP52788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMSP52788 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMSP52788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMSP52788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMSP52788 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMSP52788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMSP52788 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMSP52788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMSP52788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMSP52788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMSP52788 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMSP52788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMSP52788 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMSP52788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMSP52788 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMSP52788 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMSP52788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMSP52788 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMSP52788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMSP52788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMSP52788 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMSP52788 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMSP52788 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMSP52788 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMSP52788 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMSP52788 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMSP52788 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMSP52788 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMSP52788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMSP52788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMSP52788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMSP52788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMSP52788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMSP52788 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMSP52788 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMSP52788 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMSP52788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMSP52788 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMSP52788 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMSP52788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMSP52788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms