Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK2P51955 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK2P51955 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK2P51955 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK2P51955 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK2P51955 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK2P51955 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK2P51955 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK2P51955 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK2P51955 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK2P51955 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK2P51955 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK2P51955 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK2P51955 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK2P51955 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK2P51955 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK2P51955 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK2P51955 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK2P51955 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEK2P51955 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK2P51955 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK2P51955 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK2P51955 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK2P51955 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK2P51955 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK2P51955 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK2P51955 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK2P51955 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK2P51955 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK2P51955 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK2P51955 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK2P51955 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK2P51955 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK2P51955 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK2P51955 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK2P51955 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK2P51955 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEK2P51955 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK2P51955 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK2P51955 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK2P51955 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK2P51955 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK2P51955 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK2P51955 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK2P51955 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK2P51955 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK2P51955 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK2P51955 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK2P51955 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK2P51955 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK2P51955 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK2P51955 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK2P51955 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK2P51955 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK2P51955 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK2P51955 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK2P51955 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK2P51955 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK2P51955 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK2P51955 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK2P51955 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK2P51955 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK2P51955 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK2P51955 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK2P51955 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK2P51955 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK2P51955 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK2P51955 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK2P51955 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK2P51955 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK2P51955 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK2P51955 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK2P51955 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK2P51955 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK2P51955 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK2P51955 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK2P51955 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK2P51955 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK2P51955 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK2P51955 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK2P51955 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK2P51955 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK2P51955 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK2P51955 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK2P51955 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK2P51955 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK2P51955 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK2P51955 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK2P51955 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK2P51955 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK2P51955 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK2P51955 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK2P51955 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK2P51955 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK2P51955 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK2P51955 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK2P51955 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK2P51955 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK2P51955 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK2P51955 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms