Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMAN1P49257 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMAN1P49257 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LMAN1P49257 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMAN1P49257 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms